在现代的香港，一群青年男女朋友（包括松松与何宝生）夜里登山，无意中发现了一本古书——《清宫气数录》，遂揭开了一个晚清的风水故事……

风水奇人，擅改天机，扭转慈禧命格，种下百年祸根……

咸丰年间，满清国势如江河日下，朝廷钦天监大臣廉抱山（罗乐林）受朝廷之命，寻找延续清室气数之法。

青年何虫（何宝生）原为一小庙的庙祝（庙里从事看庙、解签、算卦的职业），但其实根本不通风水术数之学，与老庙祝（黄新）一起唬弄善信，小打小闹混口饭吃。在一次骗人把戏被精通风水术数的廉化忌（陈松伶）拆穿后，虫与忌遂成斗气冤家，更以风水布局比试斗法。虫虽不曾修习风水命理之学，却自幼天赋异禀，拥有神奇的“触机”，对风水玄学问题有独到见解，在与忌的比斗中居然未致完全落于下风。不知不觉间，两人互萌好感，情愫渐生。

其后，何虫得忌父廉抱山（罗乐林）赏识，被挑选入宫，受派领队寻找一个曰“蜻蜓点水”的上佳风水穴，以便能延续清室气数，重振声威大清声威。但山不久即惊愕于虫的天赋更在自己之上，于是利用咸丰对自己女儿廉化忌的爱慕，挑拨咸丰对虫的猜忌，将虫放逐到危险丛生的不毛之地。而在阴错阳差下，虫竟真的找到蜻蜓点水穴的端倪，虫藉此良机，重回朝廷再与山周旋。

返宫后，虫遇上刚被纳为嫔妃的兰儿，即以后的慈禧（梁小冰）。眼见兰儿受尽百般委屈，郁郁寡欢，对其产生了怜悯之心，遂借风水玄学之力，为其改变命格，助其除去宿敌顾命大臣肃顺，使其获得咸丰宠幸，摆脱了痛苦命运。忌父廉抱山也在这一场斗争中殒命，忌终不能原谅虫，在父亲葬礼中纵身跳下悬崖。

慈禧得势之后，竟背弃变革强国的许诺，更不顾当初的恩情，以“兔死狗烹、鸟尽弓藏”的手段对付相助她得到今日之位的各位义士（李耀敬、王书麒、何婉盈），唯独放过虫。虫万万也没有想到，当初自己怀着强国之心和对慈禧一时之怜悯，却种下了中国日后的百年祸根，亦开启了他自己往后的恩怨情仇……

岁月如飞梭，回头百年身。在民国青天白日旗飞扬的街头，已是一佝偻老人的虫与一老尼迎头相遇，赫然发现原来是毕生魂牵梦萦的化忌。忌亦认出了虫，但低头含泪擦身而过。虫不胜哀感……

有缘无份，造物弄人，也许是冥冥中早已注定。